Începutul Bisericii Baptiste Române din Viena are loc ca timp și spațiu în anul 1980. Unsprezece ani mai târziu, în 1991 se constituie ca Biserică-fiică a Bisericii Baptiste Austriece de pe Mollardgasse. În 2000, dobândește titlul de Biserică de sine stătătoare în Uniunea Baptistă din Austria. Iar în 2013, primește din partea statului Austriac, împreună cu alte patru biserici protestante libere, recunoașterea ca biserică cu denumirea „Freikirchen in Österreich”.
Duminică, 7 mai 2023, Biserica Baptistă Română „Bethel” din Viena a sărbătorit 40 de ani de la fondare.